Charlotte Bergesen jobber med mange ulike teknikker og formater. Hovedfokuset hennes har vært på tegning, både på papir, og gjennom animasjon og pappmache. 

Skulptur og maleri er også en viktig del av arbeidet hennes, og det figurative uttrykket har vært gjennomgående selvom arbeidene har beveget seg i abstrakt retning de senere årene.

Temaer som identitet, familie og menneskers relasjoner til seg selv og sine omgivelser har bestandig stått sentralt i kunstnerskapet. Dette er temaer hun stadig er nyskjerrig på og ønsker å utforske. 

Charlotte jobber med kontraster i historiene hun forteller. Ofte kan arbeidene se vakre og uskyldige ut ved første øyekast, men de underliggende motsetningene er alltid tilstede. Skjulte historier avdekkes og kan oppleves som ubehagelige.

De små formatene trekker tilskueren fysisk nærmere og gir en intimitet med verket. Formålet er å overraske betrakteren ved det tette møtet med arbeidet, og å invitere til undring over hvorfor ting har blitt som det har i historien som fortelles.